1、东燕帝国太祖罢中书省，废丞相， 内阁大学士一职多以硕德宿儒或朝中大臣担任，只照皇帝意旨写出，称“传旨当笔” 批准内阁在奏章上以条旨陈述己见，称为“票拟”制度。 朝位班次，俱列六部之上。自此，内阁成了中央最高的的决策机构 设置吏、户、礼、工、刑、兵六部 六部因此地位得到了提高。每部只设一个尚书，两个侍郎，原有的各科尚书降为郎中 寺包括大理寺、太常寺、光禄寺、太仆寺和鸿胪寺。大理寺与刑部和都察院合 始置御史台，设左、右御史大夫各一名 166六科机构六科，负责侍从、规谏、补阙、拾遗、稽察六部百司之事。1373年，设给事中十二人，秩正七品，始分为六科，每科二人。1391年，更定科员，每科都给事中一人，
2、正八品。六科有“封驳权”，对改善朝政发挥了一定作用郡以下设县或道。县是 。东燕地方满万户以上的县设县令，不满万户的设县长。令、长为一县之首，掌全县政务，受郡守节制。县令下设尉、丞。尉，掌全县军事和治安；丞，为县令或县长的助手，掌全县司法。郡、县主要官吏由中央任免。 此外，还有司治安、禁盗贼的专门机构，叫做亭，亭有长。 东燕规定，两亭之间相隔十里，设亭长。亭遍布于城乡各要地 主要的情报机构包括 黑衣卫、黑衣卫负责侦查国内外情报，直接对皇帝负责，拥有可以逮捕任何人，并进行秘密审讯的权利。 要职责就是监视政府官员、社会名流、学者等各种政治力量， 太师、太傅、太保为三公， 之后，三公皆为虚衔，为勋戚文武大臣加官、赠官。
