黄三德为孙中山革命所做的贡献之大，在民国建立之初，时人将孙中山称为“国父”,而黄三德则被洪门内部尊称为“国叔”。
为表彰黄三德对革命作出的贡献，1912年孙中山将卸任临时大总统之职时，发给黄氏旌义状：“黄三德君于中华民国开国之始，懋著劳绩，历久不渝，应发给最优等旌义状，奕代后民，水多厥义。此旌。”
（图为黄三德与孙中山等革命党人合影）
黄三德不但是孙中山的支持者、诤友，同时也是当时国内其他势力、军政要人所争取的对象，甚至不惜不择手段互相攻击，挑拨离间，以达到拉拢黄三德为己用的目的。
1915年，袁世凯复辟称帝，国内群起讨袁。中华讨袁军政府大元帅岑春煌、桂系军阀陆荣廷、西南护国军首领唐继尧与蔡锷等想到了“财神爷”黄三德，任命黄为“欧美筹饷专员”，一方面筹军饷，一方面挑拨是非，离间黄三德与孙中山的关系。
（图为黄三德与孙中山等革命党人合影）
由于当时民族矛盾尖锐真杂，黄三德一时无法分辨是非真伪，所以也为这些军阀筹了不少军饷，因而在一些事情上与孙中山发生了误会。
1912年，黄三德回国抵达广州．与孙中山谈及致公堂立案一事。希望致公堂能注册登记为一个合法组织，但孙中山考虑到清王朝己被推翻，洪门已完成其历史使命，故未同意洪门（致公堂）在国内立案的要求。自此，黄三德对孙中山便产生了成见。
1913年，孙中山在日本组织中华革命党，发动洪门人士一律加人，将致公堂改组为中华革命党支部。黄三德接函后，误认为孙中山不给予洪门立案，原来是想兼并洪门成为中华革命党，使本来已是满腹狐疑的黄三德，对孙中山更加不满了。
1916年，革命家黄兴病逝，黄三德回上海吊丧，并与孙中山约见。黄三德重提洪门立案问题，孙中山还是没有答应，两人不欢而散。而在1918年，当时的总统黎元洪为了拉拢黄三德，批准洪门立案。黄三德十分高兴，再找孙中山，孙还是反对，不肯签名。黄三德便说他“忘恩负义，只为自私起见，背大公无私之训”。自此，黄三德与孙中山的隔阂越来越深。
1921年，孙中山当选为非常大总统，黄三德回国参加孙的就职典礼。孙中山提到洪门改党之事，黄三德当即气上心头，说洪门向来革命，何必一定要改名称？于是争执起来，大家又不欢而散，两人的关系逐渐疏远了。
（图为黄三德以致公堂名义为孙中山的革命活动募款收据）
孙中山后来察觉到黄三德对国内革命不那么热心了，才料想其中必有误会，于是派冯自由专程赴美找黄三德面谈。经过冯自由一番实事求是、热情诚恳的解释、开导，黄三德对孙中山的误解才有所消除。
1925年，孙中山病逝，黄三德在美恒闻消息，忍不住痛哭流涕，对洪门人士说：“国父不幸，是中华民族的不幸。”
（图为黄三德在美国墓地）
1927年，64岁的黄三德为了使洪门更加兴盛，主动退位让贤，隐居美国洛杉矶度晚年，于1946在美国洛杉矶病逝，终年83岁。
黄三德虚数十年之沧桑，一直清正廉明，不谋功名。在他出殡那天，美洲界华人、洪门人士约万余人参加了葬礼，送葬的人流长达十里。当时中国政府也发去唁电，对黄三德为中国辛亥革命所作的贡献给予高度评价。
